Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARP1P09874 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARP1P09874 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP1P09874 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARP1P09874 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms