Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB7P09629 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HOXB7P09629 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXB7P09629 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms