Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACAA1P09110 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACAA1P09110 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms