Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC3A2P08195 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC3A2P08195 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms