Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTNP04004 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTNP04004 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VTNP04004 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VTNP04004 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VTNP04004 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VTNP04004 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VTNP04004 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms