Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-DRAP01903 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-DRAP01903 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms