Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX58O95786 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX58O95786 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX58O95786 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX58O95786 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX58O95786 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDX58O95786 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DDX58O95786 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDX58O95786 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDX58O95786 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX58O95786 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDX58O95786 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms