Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24AO95486 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24AO95486 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms