Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
SOGA1O94964 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SOGA1O94964 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SOGA1O94964 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms