Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOBTB3O94955 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOBTB3O94955 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms