Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR5O75473 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR5O75473 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR5O75473 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LGR5O75473 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR5O75473 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LGR5O75473 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LGR5O75473 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LGR5O75473 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms