Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPFIA2O75334 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA2O75334 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms