Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP5O75197 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP5O75197 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP5O75197 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP5O75197 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRP5O75197 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRP5O75197 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRP5O75197 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRP5O75197 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRP5O75197 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRP5O75197 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRP5O75197 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms