Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IGSF3O75054 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF3O75054 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms