Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSVO60911 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSVO60911 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTSVO60911 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms