Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCA5O60264 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCA5O60264 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCA5O60264 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms