Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PLIN1O60240 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLIN1O60240 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLIN1O60240 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms