Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB3O43889 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB3O43889 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB3O43889 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB3O43889 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB3O43889 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CREB3O43889 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB3O43889 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms