Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1BO43795 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1BO43795 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms