Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPRY3O43610 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPRY3O43610 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms