Protein–RNA interactions for Protein: O43316

PAX4, Paired box protein Pax-4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX4O43316 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAX4O43316 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PAX4O43316 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX4O43316 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAX4O43316 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAX4O43316 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAX4O43316 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAX4O43316 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAX4O43316 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAX4O43316 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms