Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEFVO15553 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEFVO15553 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEFVO15553 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEFVO15553 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MEFVO15553 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEFVO15553 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEFVO15553 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms