Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACOX3O15254 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOX3O15254 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms