Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCF2LO15068 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms