Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PODXLO00592 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PODXLO00592 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PODXLO00592 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PODXLO00592 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PODXLO00592 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms