Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX1O00570 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX1O00570 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX1O00570 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX1O00570 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX1O00570 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX1O00570 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX1O00570 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX1O00570 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOX1O00570 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms