Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AGRNO00468 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGRNO00468 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGRNO00468 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms