Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP2O00295 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TULP2O00295 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TULP2O00295 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TULP2O00295 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TULP2O00295 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TULP2O00295 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TULP2O00295 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP2O00295 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms