Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAPO00193 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAPO00193 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAPO00193 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAPO00193 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAPO00193 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAPO00193 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAPO00193 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAPO00193 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms