Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC01387J3KSC0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC01387J3KSC0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms