Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms