Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9IYK1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C9IYK1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9IYK1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9IYK1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C9IYK1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9IYK1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9IYK1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms