Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CENPBD1B2RD01 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CENPBD1B2RD01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.3 ms