Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P5A8MQ11 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P5A8MQ11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms