Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC10BA6NIK2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC10BA6NIK2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms