Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CBY3A6NI87 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CBY3A6NI87 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms