Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
STRCP1A6NGW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCP1A6NGW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms