Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBFOX3A6NFN3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms