Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6L3A6NEY3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms