Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms