Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L4A6NCW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L4A6NCW7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms