Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C5orf49A4QMS7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C5orf49A4QMS7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms