Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC66A2RUB6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms