Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf170A2RU37 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms