Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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TCRBV5S1A1TA0A578 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBV5S1A1TA0A578 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCRBV5S1A1TA0A578 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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