Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0D9SFI3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms