Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMTA1Q9Y6Y1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms