Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
LAMC3Q9Y6N6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LAMC3Q9Y6N6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC3Q9Y6N6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms