Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms