Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC4Q9Y696 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC4Q9Y696 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms